Hier wordt één enkele zaadcel in een eicel geïnjecteerd door middel van een flinterdun glazen capillair. De andere stappen van de ICSI-behandeling, zoals hormonale stimulatie van de eierstokken of het verzamelen van eicellen, zijn dezelfde als bij normale IVF. ICSI wordt vooral gebruikt wanneer het aantal, de beweeglijkheid en de uiterlijke kenmerken van de zaadcellen zeer beperkt zijn.